首先增值稅的稅負率=（本期應納稅額÷本期應稅主營業務收入）×100%。
其次，不同行業不同地區在不同時期的增值稅稅負率均有不同，稅負率是個變動的數據，即使是有相關的平均稅負率參考，也不能證明偏離此數據，就一定是存在風險的。
最后，在實務中，稅局僅是將橫向的增值稅稅負率作為參考，更多的是評估企業的縱向的增值稅變動率與企業的其他指標相比較，比如今年的稅負與去年同期的稅負變動情況，該數據會與利潤率的變動進行比較，如果存在利潤率和稅負率增長出現倒掛，不合邏輯，就有可能會出現預警；
或者今年的銷售額比去年增長了，但是增值稅的稅負率明顯下降，也可能會列入疑點范圍等等。
因此，企業不能僅根據增值稅稅負率的單一指標來判斷是否正常，要結合各期數據進行分析判斷。增值稅稅負率偏高并不代表著一定正常，增值稅稅負率偏低也不代表著一定異常。過高或過低都有可能達到預警，稅局可能會結合進項稅金控制額來進一步分析企業是否存在進項稅的問題等。
