據國外媒體報道， 微軟發布Internet Explorer 8第二個公眾測試版僅一天，已經有讀者反映，警告這款軟件在安裝和某些網站與服務可能碰到不相容的狀況。雖然這種情況發生在測試版軟件是意料之中，某些不相容卻是針對微軟本身的服務。
微軟承認當中部分的問題。IE開發團隊日前在一篇博客中，解釋在Windows XP SP3環境中使用IE 8的用戶，必須先卸載service pack，才能降級回IE 7。確實，依據不同的Windows版本，32位元或64位版，不論安裝或移除IE 8，都需要特定的步驟。例如，Windows Vista使用者必須先下載安裝SP1，才能安裝IE 8 Beta 2。
其他已知的相容問題涉及ClearType(在Windows Live Mail之外的使用)和若干搜索功能。Windows Live Meeting無法識別Internet Explorer 8 Beta 2為其支持的瀏覽器之一。
使用者通報的另一個較嚴重的問題是有關Windows Live Meeting 2007。本站已經證實，不論是網路或客端下載版的Live Meeting，都無法在Internet Explorer 8 Beta 2之下執行，該軟件內建的相容性功能也無法改正這項錯誤。
此外，使用者還通報了IE 8 Beta 2無法進入Netflix "Watch Now"線上串流服務。
